Het verhaal van Bobby en de geestenjagers gaat over Sanne (12) die met haar vader, een gerenommeerde geestenjager, naar het schip meegaat om daar geesten uit te drijven die het de gasten van de SS Rotterdam soms flink ongemakkelijk maken. Maar eenmaal op het schip maakt ze kennis met Bobby (15), een van de achtergebleven geesten. Sanne vindt hem meteen aardig en hoort van Bobby wat er allemaal speelt bij de geesten. Die geesten zijn zo slecht nog niet maar willen het liefst gewoon met rust gelaten worden. Een uitdrijving door geestenjagers heeft voor hen catastrofale gevolgen. Evengoed gaat haar vader aan het werk. Zal Sanne hem nog op tijd weten te overtuigen de geesten met rust te laten en zo Bobby te redden?